2000年，杭州奧默醫藥誕生
2001年，新藥實驗室建立
2002年，建立新藥篩選、研發體系 　
2003年，發明抗腫瘤候選藥Q523 　
2004年，肌松拮抗劑1.1類新藥Aom0498完成成藥性研究
2005年，發明新抗生素Cs007 　
2007年，麻醉1.1類新藥Aom0765研究立項 　
2008年，“明日之藥”奧默清醇片進軍國際市場 　
2009年，抗糖尿病1.1類新藥研究立項 　
2010年，第一個1.1類新藥Cs007申報；奧默醫藥黨支部成立 　
2011年，評為杭州市高新技術企業；奧默醫藥工會成立
2012年，獲“十二五”國家“重大新藥創制”立項、 　　
獲得國家科技型中小企業創新基金；
獲浙江省“十二五”重大科技專項；
評為杭州市專利試點企業； 　
2013年，中國科學院奧默院士專家工作站成立
2014年，公司整體變更為杭州奧默醫藥股份有限公司
2014年，杭州市企業技術研發中心
2014年，評為國家高新技術企業
2015年, 全國中小企業股份轉讓系統(新三板)掛牌
被評為浙江省高新技術企業研究開發中心
2016年，國家十三五“重大新藥創制”重大專項立項
8月浙江省藥物一致性評價研究中心在公司掛牌
2017年，被評為“杭州市專利試點企業”